Ca. 2-5% der Bevölkerung sind ohne jegliche Symptome mit Clostridiodes diffecile besiedelt. Diese Besiedlung kann von kurzer oder jahrelanger Dauer sein und hat beim gesunden Menschen keine krankmachende Eigenschaft.
Besiedelte Personen scheiden Clostridiodes difficile in geringen Mengen mit dem Stuhl aus. Für gesunde Menschen in der Umgebung stellt dies jedoch keine Gefahr dar.