Für einen Gesunden mit einer intakten Darmflora ist eine Besiedlung des Darmes mit Clostridiodes assoziierte Diarrhoe in der Regel nicht bedenklich. Eine Erkrankung durch Clostridium difficile findet in der Regel erst nach Vorschädigung der normalen Bakterienbesiedlung des Darmes statt, insbesondere unter bzw. nach einer Therapie mit Antibiotika. Die Ausprägung der Erkrankung reicht von leichten Durchfällen bis zu schweren lebensbedrohlichen Darmentzündungen.