Grundsätzlich ist zwischen einer bloßen Besiedlung (Kolonisation), z.B. im Darm und einer Infektion zu unterscheiden. Eine reine Kolonisation im Darm besitzt keinen Krankheitswert. Bei einer Infektion mit entsprechender klinischer Symptomatik wird nach ärztlichem Ermessen eine antibiogrammgerechte antibiotische Therapie durchgeführt. Wie bei jeder schweren Infektion, z.B. einer Blutvergiftung (Sepsis), kann aber nicht immer ein therapeutischer Erfolg garantiert werden.