Es gibt bisher nur wenige Untersuchungen über die MRSA-Besiedlung von den verschiedenen Nutztiergruppen. Es gibt auch positive MRSA-Nachweise in Beständen von ökologischer Tierhaltung, diese scheinen jedoch gegenüber Betrieben mit konventioneller Nutztierhaltung deutlich weniger ausgeprägt. Ursächlich könnte hierfür der geringere Antibiotikaeinsatz in der ökologischen Tierhaltung sein.