Eine Dekolonisierung sollte immer angestrebt werden, solange keine sanierungshemmenden Faktoren vorliegen (s.o.). Wenn Sanierungshemmnisse vorliegen, muss im Einzelfall eine Abwägung erfolgen. So kann zum Beispiel präoperativ ein Sanierungsversuch auch bei vorliegenden Sanierungshemmnissen sinnvoll sein, um die Keimlast zu reduzieren.